「マルハ」とは、創業当時の社名である林兼商店が丸枠の中に「は」の字を入れた商標を用いていたことに由来する。また、航海中『荒波（は）を丸く収める』という意味も掛けられていた。
戦後～1970年代初頭にかけては、世界中至る所で漁業を行っていた。当然鯨も多く捕獲しており、これが傘下のプロ野球球団名の由来となった。この頃まで経営は順調であったが、EEZが設定されてからは自由に操業できなくなったことで、会社にとって試練が続くようになる。
1980年代後半のバブル期には不動産投資やゴルフ場経営など、多角化を推し進めるもいずれも失敗する。
だが、現在はリストラで不採算事業から撤退したことで、経営は大きく改善する。電子レンジ加熱食品事業に乗り出すなど総合食品会社へと転換を図り、それ以外にもマグロの養殖、健康志向からDHA需要の高まりを受けてDHA入りソーセージの発売や、魚肉加工品の卸売りなど、様々な事業を行っている。