バイオディーゼルとは生物由来油から作られるディーゼルエンジン用燃料の総称で、バイオマスエネルギーの一つである。てんぷら油など廃食油からグリセリンをエステル交換により取り除き粘度を下げディーゼルエンジンに使用できるようにしたものもある。
装置が比較的小型ですむため個人や小規模な団体でも製造が可能という利点がある。また地球温暖化防止のため策定された京都議定書では、生物由来となる燃料は二酸化炭素の排出量として換算しないため、バイオアルコールなどとともに世界各国での注目を集めている。化石燃料を燃焼させることは、化石燃料に含まれる二酸化炭素を現代の大気中に新たに追加させることになる。一方バイオディーゼルを燃料として燃焼させるということは、地球上の大気内の二酸化炭素を植物などの生物が吸収し、その生物から作られる燃料を燃焼させても、もともと大気内に存在した以上の二酸化炭素を発生させることはない、ということから太陽光や風力などと同じ循環型エネルギーに位置づけられる。